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基因組學(xué)應(yīng)用精選(九篇)

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基因組學(xué)應(yīng)用

第1篇:基因組學(xué)應(yīng)用范文

【關(guān)鍵詞】民族音樂學(xué)、錄音、記譜,

導(dǎo)言

民族音樂學(xué)(Ethnomusicology)是一門實(shí)踐性很強(qiáng)的,不同于諸如音樂美學(xué)等思辨性的學(xué)科,無論是它的理論還是研究方法都是民族音樂學(xué)家們從自身和前輩的大量田野工作和實(shí)驗(yàn)室研究工作中總結(jié)出來的。而民族音樂學(xué)的每個發(fā)展階段里,科學(xué)技術(shù)的應(yīng)用在某種程度上起到了不可忽視的作用。尤其是計(jì)算機(jī)的出現(xiàn),對其具體的資料收集過程、研究過程,分析過程和結(jié)果以及音樂學(xué)學(xué)科的繁榮和進(jìn)步等方面都產(chǎn)生了積極的影響。

一、在資料收集方面:

1877年愛迪生發(fā)明了留聲機(jī)。這一裝置的誕生對民族音樂學(xué)的研究,特別是對一般人難以接觸到的無文字民族音樂的研究產(chǎn)生了無法估量的推動作用。因?yàn)橹挥性谑褂眠@一器械之后,才有可能把不同民族和部族的音樂客觀、實(shí)際地記錄下來,才能避免單憑聽覺進(jìn)行記譜所帶來地主觀偏差,才有可能對記譜難以反映出來的音色、演奏演唱風(fēng)格和技巧進(jìn)行具體地比較分析。

錄音機(jī)的發(fā)明和使用,使得19世紀(jì)90年代首先在美國,隨后1900年在奧地利科學(xué)院和1902年在德國柏林大學(xué)心理學(xué)研究所建立了音響檔案館,并隨之形成了一套相對規(guī)范化的錄音方法與要求以及比較系統(tǒng)的音響資料分類、保存和分析的方法??梢哉f錄音機(jī)的發(fā)明和應(yīng)用為這門學(xué)科的創(chuàng)建和獨(dú)立發(fā)展奠定了物質(zhì)和技術(shù)基礎(chǔ)。

現(xiàn)在計(jì)算機(jī)技術(shù)在錄音領(lǐng)域的使用,即“數(shù)字錄音”以其巨大的優(yōu)勢又為民族音樂學(xué)的銻田野工作提供了更好的技術(shù)支持。比如:

1)數(shù)字錄音的保真性能很高,可以更加清晰地記錄所采集的音樂內(nèi)容,保證了采集的音響資料在回放時的原汁原味,使得研究誤差大大減少。

2)動態(tài)范圍大,避免了模擬錄音輸入信號過大而產(chǎn)生的失真,使得錄音工作不會由于失真而白費(fèi)功夫。

3)信噪比高,減少了模擬設(shè)備自身產(chǎn)生的躁聲;提高了聲音樣本的清晰度。

4)經(jīng)過多次復(fù)制后不會降低聲音質(zhì)量。避免了資料經(jīng)過多次拷貝后的音質(zhì)損傷。

5)重放的精度高,不會改變速度。磁帶記錄的資料在回放時經(jīng)常由于機(jī)器或其他因素導(dǎo)致速度變化。

6)記錄密度高,記錄時間長。使用數(shù)字錄音機(jī)可以錄制幾十甚至上百小時的資料,大大減少了研究者的筆記工作,使得采訪過程得以原樣再現(xiàn)。

7)體積小,攜帶方便,并且資料儲存空間大大提高,相比開盤磁帶等儲存介質(zhì)來說,光盤,硬盤等數(shù)字介質(zhì)的優(yōu)勢是極其巨大的。

二、在對音樂本體的分析和研究方面:

1962年奧地利的瓦爾特格拉夫首次提出了使用聲譜儀去分析音樂現(xiàn)象。在一片論文中他對這種研究進(jìn)行了闡釋,認(rèn)為:“音樂的音響體驗(yàn)時可以從聲學(xué)和文化領(lǐng)域的特點(diǎn)方面加以評定的,其整個過程可以用客觀上能夠確定的聲學(xué)特點(diǎn)去把握這種體驗(yàn)的主要特征,以便盡可能深入和可靠地揭示其音樂學(xué)方面的種種關(guān)聯(lián),……事實(shí)上也看不出有什么理由要把物理學(xué)――聲學(xué)排除在研究之外?!崩鐝奈锢矸矫鎸δ承┐呙咔奶厥獍l(fā)聲進(jìn)行描寫分析和研究,這對于探討音樂體驗(yàn)和美學(xué)問題都是十分有意義的。格拉夫也反復(fù)強(qiáng)調(diào),聲譜儀只是通往具有更高價值的信號加工的一條途徑。

現(xiàn)代計(jì)算機(jī)與聲譜儀的結(jié)合應(yīng)用可以為音響的分析與研究提供一種更為科學(xué)準(zhǔn)確的手段:用計(jì)算機(jī)可以作頻譜分析,包絡(luò)分析,波形分析,瞬態(tài)分析,繪制三位聲圖。測量基頻等;也可以作為聲學(xué)工作站,替代各種聲學(xué)測量儀器。在具體分析音樂的時候,可以有對資料中旋律進(jìn)行時,相鄰音之間的音程分析;有對上下行級進(jìn)和跳進(jìn)規(guī)律的分析,有對多聲部音樂中使用的各級和弦出現(xiàn)次數(shù)或累計(jì)時值的分析等。通過這些分析能發(fā)現(xiàn)某個地區(qū)或民族的音樂的特點(diǎn)。還有通過各音出現(xiàn)次數(shù),頻度和結(jié)束音等進(jìn)行調(diào)式分析,如判斷各地單旋律的民歌的調(diào)式。還有節(jié)奏分析,模式識別,動態(tài)分析等等。

三、記譜方面:

民族音樂學(xué)使用的記譜大致又以下幾種方式

1)最早的一種就是現(xiàn)場記譜。即田野工作者在聽到某首歌曲時候,就將它記錄下來。但是這種方式不太精確。

2)另一種方法就是把受訪者請到研究室中進(jìn)行當(dāng)場記譜。隨著錄音技術(shù)的發(fā)明和普及這種方式已經(jīng)較少使用,取而代之以錄音來進(jìn)行記譜。

3)計(jì)算機(jī)自動記譜儀的發(fā)明對于記譜來說是一次比錄音技術(shù)的出現(xiàn)更帶根本意義的革命。它一方面增加了記譜的準(zhǔn)確性,而另一方面卻又會使民族音樂學(xué)家減低對自己記譜工作的控制能力,從而成為這種設(shè)計(jì)精巧,能產(chǎn)生種種圖表的,但卻不能引起音樂家興趣的種種信息的奴隸。

其實(shí),實(shí)現(xiàn)計(jì)算機(jī)實(shí)時記譜的困難是很大的。首先,沒有伴奏的實(shí)時的歌唱的高音標(biāo)準(zhǔn)很難確定,常常是距標(biāo)準(zhǔn)音很遠(yuǎn)(例如差幾十音分),而且不時游動:還有,光就一般人(包括被訓(xùn)練有素的歌唱家)來說,保持發(fā)某一音高的音,偏離標(biāo)準(zhǔn)音高幾十音分也是常有的。這樣就會造成按譜上或主觀唱出的應(yīng)是同一個音高,但記下的譜上卻會出現(xiàn)在兩個或更多個半音上。升降號的用法也很繁瑣,按固定唱名法記下的譜又常常有許多升降號,看起來很不習(xí)慣,也不實(shí)用。速度和節(jié)拍的把握也是問題。按怎樣的速度記譜? 多長時間是一拍?這也無法規(guī)定,即使規(guī)定了也在變。因此,記下的譜上又都是隔小節(jié)的連音號而無法劃分小節(jié)線!

還有,對于不同調(diào)性,也無法反映,只會攪得亂成一團(tuán),等等。所以,它們只能供研究者分析用,卻不能使人從它們所提供的種種符號中直接讀出音樂來,因此至今也未能取代傳統(tǒng)記譜的地位,而僅作為音響分析的一種輔的研究工具,并非音樂分析的主要手段。

四、民族音樂學(xué)中的器樂研究

計(jì)算機(jī)技術(shù)在樂器聲學(xué)研究中也得到了很多應(yīng)用。例如計(jì)算律管音孔位置、形狀,管徑的變化,吹口邊棱狀況及管尾長短等對于音高或音質(zhì)的影響,以及對于音孔位置的研究等。還可以設(shè)計(jì)出可以直接聽到上述結(jié)果聲音的計(jì)算機(jī)程序,從而可以對古代記載的樂器進(jìn)行還原或者再發(fā)明出新的樂器。

第2篇:基因組學(xué)應(yīng)用范文

關(guān)鍵詞:功能基因組;高通量數(shù)據(jù);生物信息學(xué)

中圖分類號:Q933 文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:1671-2064(2017)10-0190-01

功能基因組學(xué)(后基因組學(xué)),是在結(jié)構(gòu)基因組所提供的豐富的高通量信息資源以及大量各類生成產(chǎn)物的基礎(chǔ)上發(fā)展起來的基因組學(xué)的子學(xué)科。其通過在功能基因組水平或功能系統(tǒng)水平上全面地分析基因的功能,發(fā)展和提出了多種實(shí)驗(yàn)手段和分析方法,使得生物學(xué)的研究對象由單一基因或蛋白質(zhì)轉(zhuǎn)為多個基因或蛋白質(zhì)組成的系統(tǒng),進(jìn)而得到關(guān)于基因表達(dá)、調(diào)控、功能以及生物的生長、發(fā)育的相關(guān)規(guī)律。

1 差異顯示反轉(zhuǎn)錄PCR技術(shù)

差異顯示反轉(zhuǎn)錄PCR(DDRT―PCR)技術(shù)是由Liang和Pardee等提出的,以PCR和聚丙烯酞胺凝z電泳為基礎(chǔ)的功能基因組學(xué)的傳統(tǒng)方法。該方法的基本原理是:以1對細(xì)胞(或組織) 的總RNA反轉(zhuǎn)錄而成的cDNA為模板,利用PCR的高效擴(kuò)增,通過5’端和3’端引物的合理設(shè)計(jì)和組合,將細(xì)胞(或組織) 中表達(dá)的基因片段直接顯示在DNA測序膠上,從而找出1對細(xì)胞(或組織)中表達(dá)有差異的cDN斷。DDRT―PCR具有周期短,功能多,靈敏度高,所需RNA的量較少并且重復(fù)性較高等優(yōu)點(diǎn)。但是,在實(shí)際施行過程中, DDRT―PCR技術(shù)存在著假陽性率高、凝膠中單條cDNA帶成分不均一、所獲cDNA僅代表mRNA 3’UTR(非翻譯區(qū))、一些低拷貝數(shù)mRNA不能有效呈現(xiàn)等問題。[1]

2 基因表達(dá)序列分析

基因表達(dá)序列分析(SAGE)是Velculescu等人建立的一種快速高效地分析轉(zhuǎn)錄物的實(shí)驗(yàn)方法。其理論依據(jù)是:基因組中95%的基因可以由來自cDNA 3’端特定位置的一段9―11bp長的序列加以區(qū)分。這一段特異的基因序列被記作SAGE標(biāo)簽?;虮磉_(dá)序列分析通過對cDNA制備SAGE標(biāo)簽,然后將這些標(biāo)簽串聯(lián)起來并對其進(jìn)行測定,可以顯示出各SAGE標(biāo)簽所代表的基因在特定的組織中是否有表達(dá),同時還可以將SAGE標(biāo)簽所出現(xiàn)的頻率作為其所代表的基因表達(dá)程度的指標(biāo)。但是,應(yīng)用SAGE技術(shù)有一個重要前提條件:GenBank中必須有某一物種足夠多的DNA序列的資料(特別是EST序列的資料)。[2]

3 微陣列分析

DNA微陣列(microarray assay)技術(shù)包括cDNA微陣列和DNA芯片(DNA chip)兩種方法,這兩種方法的原理相同。首先是在固相表面合成成千上萬個寡核苷酸“探針”(cDNA、EST或基因特異的寡核苷酸),該過程會用到光導(dǎo)化學(xué)合成、照相平版印刷和固相表面化學(xué)合成等技術(shù)。接著將寡核苷酸“探針”與來自不同細(xì)胞、組織或整個器官的用放射性同位素或熒光物標(biāo)記的DNA或mRNA反轉(zhuǎn)錄生成的第一鏈cDNA進(jìn)行雜交。最后對每個雜交點(diǎn)進(jìn)行定量分析。定量分析的結(jié)果可以用于DNA測序、DNA突變和多態(tài)性分析以及對同一組織細(xì)胞在不同狀態(tài)下或在同一狀態(tài)下多種組織細(xì)胞基因表達(dá)水平的差異的檢測,還可以發(fā)現(xiàn)新的致病基因或疾病相關(guān)基因等。微陣列分析的優(yōu)點(diǎn)是可以同時對大量的基因,甚至是整個基因組的基因表達(dá)進(jìn)行對比分析,并且在核苷酸雜交技術(shù)的各個方面應(yīng)用。其在同時比較同一組織在不同狀態(tài)下或各組織之間DNA序列分析以及基因的表達(dá)狀況等方面具有極大的優(yōu)越性。

4 反義RNA分析

反義RNA是能與靶RNA互補(bǔ)配對的,用來定點(diǎn)分析某一段DN段(基因)功能的小分子RNA。反義RNA分析即是利用反義RNA來進(jìn)行功能基因組分析的方法。該方法首先分離基因片段的mRNA,合成其mRNA的互補(bǔ)RNA(反RNA)。然后給反RNA加上基因表達(dá)必需的元件(如啟動子等),接著插入T-DNA。將其轉(zhuǎn)化到植株中,那么合成的基因就會在植株中表達(dá),并表現(xiàn)出相應(yīng)性狀。因?yàn)榉戳xRNA與靶RNA堿基配對的結(jié)合方式,反義RNA可以在DNA復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯水平上對基因表達(dá)加以調(diào)控。

5 蛋白質(zhì)組分析

蛋白質(zhì)組分析方法主要涉及兩個步驟:蛋白質(zhì)的分離和蛋白質(zhì)的鑒定。用于蛋白質(zhì)分離的技術(shù)主要是雙向凝膠電泳(2-dimensional gel electrophoresis,2-DE),其原理是細(xì)胞抽提物在電泳過程中蛋白質(zhì)個體首先依據(jù)所帶電荷然后依據(jù)分子大小被分離。這種方法的最大缺點(diǎn)是重復(fù)性差,使得幾乎不能同來自其他實(shí)驗(yàn)室的資料進(jìn)行比較。

6 生物信息學(xué)

生物信息學(xué)將DNA和蛋白質(zhì)作為研究對象,以計(jì)算機(jī)等計(jì)算工具為基礎(chǔ),發(fā)展更新各種軟件,收集、整理和儲存DNA和蛋白質(zhì)的序列和結(jié)構(gòu)數(shù)據(jù),并加以分析進(jìn)而發(fā)現(xiàn)藏在基因序列中的規(guī)律。應(yīng)用生物信息學(xué)可以對功能基因組研究過程中產(chǎn)生的高通量,高維度的數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,應(yīng)用數(shù)理統(tǒng)計(jì)的方法,以計(jì)算機(jī)的快速運(yùn)算能力,找到功能基因組的相關(guān)信息。常應(yīng)用生物信息學(xué)將未知DNA序列與數(shù)據(jù)庫中收集的DNA序列進(jìn)行同源性比較,或應(yīng)用相關(guān)軟件進(jìn)行核苷酸及氨基酸序列的同源性比較,以此來獲得未知DNA序列的功能信息。[3]

7 小結(jié)與展望

隨著發(fā)展,基因組學(xué)由結(jié)構(gòu)基因組學(xué)向功能基因組學(xué)發(fā)展,由此也產(chǎn)生了大量應(yīng)用于功能基因組研究的工具和方法。這些方法從不同的角度和方向挖掘基因本身蘊(yùn)含的豐富信息資源。功能基因組學(xué)無論是應(yīng)用于獲取大量基因功能信息,亦或是針對特定基因的研究都取得了突破性的進(jìn)展,發(fā)展速度迅速。但隨著各類研究的不斷深入進(jìn)行,這些方法的精確性和準(zhǔn)確性會漸漸不再滿足條件,同時各項(xiàng)技術(shù)尚未解決的一些問題也會被放大,單個方法或技術(shù)可能難以對新的問題有較好的應(yīng)用。結(jié)合各種方法,揚(yáng)長避短,綜合應(yīng)用各種技術(shù)可以對功能基因組有更全面、深入的研究。[4]

功能基因組學(xué)的應(yīng)用十分廣泛,從動物、植物到微生物群落分析都可以取得較好的研究成果,也可以應(yīng)用于醫(yī)藥、毒理等領(lǐng)域。隨著計(jì)算機(jī)技術(shù)的發(fā)展,將生物信息學(xué)應(yīng)用于功能基因組學(xué),借助計(jì)算機(jī)強(qiáng)大的計(jì)算能力,功能基因組學(xué)將能取得更大的突破。

參考文獻(xiàn)

[1]趙錦榮,閻小君,蘇成芝.差異顯示反轉(zhuǎn)錄PCR 技術(shù)研究進(jìn)展[J].生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展,2000,27(1):28-32.

[2]常青山,余增亮.基因表達(dá)分析方法及其研究進(jìn)展[J].生物技術(shù)通報(bào),2002,(6):27-31.

第3篇:基因組學(xué)應(yīng)用范文

作者單位:163111 黑龍江省大慶市中醫(yī)院

1 藥物基因組學(xué)

基因組是指生物體內(nèi)全部的DNA的集成,或基因彼此間的巧妙結(jié)合,即稱為人體基因組。藥物基因組學(xué)較為簡單的定義是“研究一個大的基因集成,乃至整個基因組的變異與藥物作用不定之間的相關(guān)性”,或“藥物(藥理學(xué))與基因組相結(jié)合的科學(xué)”,即稱為藥物基因組學(xué);另也可以說是“基因功能學(xué)與分子藥理學(xué)有機(jī)結(jié)合的科學(xué)”,或是“以藥物效應(yīng)及安全性為目標(biāo),研究各種基因的突變與其相關(guān)性”。更為具體的詮釋藥物的基因組學(xué)是“研究完整基因,包括基因特性、基因表達(dá)及基因功能在藥物效應(yīng)個體差異中的作用”。 就是從基因組水平出發(fā),研究基因序列的多態(tài)性與藥物效應(yīng)多樣性之間的關(guān)系。

藥物基因組學(xué)是確定個體遺傳基因差異,對藥物效應(yīng)的影響,它是在人類基因組計(jì)劃完成后衍生的一門新興科學(xué),未來對實(shí)現(xiàn)個體化治療有很大的助益。如藥物基因組學(xué)可為患者的選藥決策提供更多的信息,使之更好的進(jìn)行靶向治療、降低不良反應(yīng)以及對疾病的早期干預(yù)成為可能,從而獲得藥物經(jīng)濟(jì)學(xué)的最佳效益。

2 個性體給藥

近年來,隨著藥物基因組學(xué)的不斷發(fā)展,患者的遺傳結(jié)構(gòu)對藥物反應(yīng)個體差異的影響越來越受到人們的重視,正因?yàn)榕R床上存在這樣明顯的藥物反應(yīng)個體差異,所以,一直以來都希望可以實(shí)現(xiàn)-個體化用藥,如何根據(jù)每個患者的具體情況,制定有效而安全的個體化治療方案,長期以來一直是困擾臨床醫(yī)生的一個難題。雖然可通過體重、體表面積、不同年齡等方法計(jì)算調(diào)整用藥劑量,但由于影響藥物體內(nèi)過程的因素眾多,故仍未能很好的解決這一問題,有些藥物可根據(jù)臨床表現(xiàn)和生化指標(biāo)判斷療效,有經(jīng)驗(yàn)的臨床醫(yī)生可據(jù)此調(diào)整患者的劑量,而不需測定藥物濃度。但當(dāng)藥物本身不具有客觀的效應(yīng)指標(biāo)時,根據(jù)其藥物效應(yīng),作為個體化的標(biāo)準(zhǔn)并不現(xiàn)實(shí)。

研究表明,許多藥物的血藥濃度與藥理效應(yīng)強(qiáng)度間有很好的相關(guān)性,而越來越多的藥物檢測方法的引入,使僅微量存在的藥物檢測得以進(jìn)行。所以以血藥濃度為客觀依據(jù)運(yùn)用藥代動力學(xué)理論,指導(dǎo)制定合理用藥方案,日益為廣大臨床醫(yī)生接受和采用,從而促進(jìn)了以血藥濃度監(jiān)測為主要內(nèi)容的治療藥物檢測(TDM)的發(fā)展。目前,TDM在歐美發(fā)達(dá)國家,已經(jīng)成為臨床化學(xué)實(shí)驗(yàn)室的主要常規(guī)工作之一。我國從80年代開始逐步開展這項(xiàng)工作。隨著TDM和藥物遺傳學(xué)等藥學(xué)監(jiān)護(hù)模式的進(jìn)一步發(fā)展我們不僅能監(jiān)測患者藥物濃度是否在治療范圍,還可以前瞻性的用患者特異性遺傳信息來監(jiān)測藥物治療,即根據(jù)患者的基因分型來制定患者的用藥劑量,從而進(jìn)一步提高臨床治療效果,減少不良反應(yīng)的發(fā)生,是藥物監(jiān)測走上一個新的臺階。

用藥不同患者對藥物的療效與不良反應(yīng)各不相同,發(fā)展個體化給藥是必然趨勢。研究表明,已選擇性環(huán)氧化酶-2抑制劑為代表的新型抗炎鎮(zhèn)痛藥的療效僅為80%,抗抑郁藥的有效率為62%,抗哮喘藥和抗心律失常藥的有效率分別為60%,抗糖尿病藥的有效率為57%,抗急性偏頭痛藥的有效率為52%,預(yù)防偏頭痛藥的有效率為50%,抗HCV藥的有效率為47%,抗尿失禁藥的有效率為40%,而抗腫瘤藥的有效率更低,僅為25%;同時各種藥物不良反應(yīng)發(fā)生率也相差很大,有的人僅僅接觸極微量青霉素即發(fā)生過敏反應(yīng)性休克,有的甚至死亡,而更多的人則無不良反應(yīng)。此外,更多的現(xiàn)象是同一劑量,有些人表現(xiàn)為無效,有的人甚至中毒。反之,如欲達(dá)有效治療作用,不同人群的劑量相差甚遠(yuǎn)。而接受同一劑量的血藥濃度可相差幾十倍!

第4篇:基因組學(xué)應(yīng)用范文

筆者認(rèn)為:影響學(xué)生解題成敗的因素主要是以下幾個方面:

1 對分類計(jì)數(shù)原理和分步計(jì)數(shù)原理的理解水平

學(xué)生對分類計(jì)數(shù)原理普遍認(rèn)為比較容易理解,個別題目難度來自于學(xué)生的分類方法是否恰當(dāng).大多數(shù)學(xué)生對分步計(jì)數(shù)原理的運(yùn)用不夠熟練.通過與學(xué)生交流,筆者發(fā)現(xiàn),學(xué)生對此原理的認(rèn)識僅限于記住它的內(nèi)容,而對教科書中的一個簡單例子并沒有理解到位.筆者又舉了另外例子:現(xiàn)有兩頂不同顏色的帽子,3件不同品牌的上衣,4條不同品牌的褲子,某人從中各選一件穿戴,有多少種不同選法?問題答案很簡單,學(xué)生都能答出來:2×3×4=24(種),但讓學(xué)生解釋為什么是這一算式,能說清楚的學(xué)生并不多.對此算式的解釋是樸素的:對第一步:某人只有兩種選法,但對其中一種顏色的帽子而言,他選擇上衣的方法是3種,所以他實(shí)現(xiàn)前兩步有6種方法,而對這6種方法中的每種,他選擇褲子的方法是4種,故有24種方法.這種樸素的解釋里面其實(shí)蘊(yùn)涵了分析問題的方法.

例1 把1、2、3這三個數(shù)字填到下面的九宮格內(nèi)(如圖1),要求同一行,同一列中數(shù)字互不相同,問有多少種不同填法?

解析 不妨先填第一行,有A33=6種;從這6種里任選一種固定,比如依次填上1、2、3,對這一種填法,不難發(fā)現(xiàn)下面兩行只有2種法填,所以共有A33·2=12(種),學(xué)生對此種問題處理時主要困難是不會“固定”.

例2 某人要把4種不同的顏色涂到如圖2所示的三棱拄各頂點(diǎn),要使同一條棱上兩頂點(diǎn)顏色不同,每種顏色都用到,問有多少種不同涂法?

解析 對圖2作拓?fù)渥儞Q為圖3,不妨設(shè)四種顏色為a、b、c、d. 第一步,先對點(diǎn)A、B、C著色,有A34種方法;第二步,不妨設(shè)A點(diǎn)處涂了顏色a,B點(diǎn)處涂了顏,C點(diǎn)處涂了顏色c, 因D、E、F處必有一點(diǎn)涂顏色d,有3種方法;第三步,不妨設(shè)D處涂了顏色d,則E處可涂a或c,若E處涂顏色a, 則F處只能圖顏,若E處涂c,則F處可涂顏色a或顏,故實(shí)現(xiàn)第三步只有3種方法,所以,N=A34·3·3=216(種).

2 對排列與組合概念的理解

學(xué)生對數(shù)學(xué)概念的理解是解決一切數(shù)學(xué)問題的基礎(chǔ),這是取得共識的教學(xué)理念. 實(shí)際情況是學(xué)生對排列與組合概念的理解受到教科書中那個晦澀的定義的干擾,造成理解上的困惑,致使解題受阻.常見的錯誤有以下幾種:

2.1 對排列與組合的定義的理解模糊

例如:4個人,平均分成2組,有幾種不同的方法?許多學(xué)生回答為C24=6(種),原因是他認(rèn)為分組就是組合,把組合理解成一個過程.甚至“組合”的詞性也發(fā)生了變化,由名詞變成了動詞.對這一點(diǎn),我更贊成前蘇聯(lián)的教科書中對組合的定義:“有限集合叫做組合”;

2.2 對組合數(shù)和排列數(shù)的概念理解不清晰

例如筆者在給高三學(xué)生上復(fù)習(xí)課時給出以下問題:現(xiàn)有6種不同的蔬菜種子,從中選出4種種到4塊不同的地上,每塊地只限種一種種子,問有多少種不同種法,大多數(shù)學(xué)生回答是:C46·A44,只有個別人回答是:A46 ,顯然回答出前面的答案的學(xué)生是受到先組后排的解題經(jīng)驗(yàn)的影響,從而也從另一側(cè)面反映出很多學(xué)生對排列數(shù)A46的理解還不很清晰.

對Amn的解釋是:從n個不同元素中取出m個不同的元素占據(jù)m個不同的位置,每個元素一個位置,有Amn種方法.

例3 5個相同的球放到3個不同的盒子,每盒至少一個,有多少種放法?

錯誤解答:C15C14C33A22·A33+C15C24C22A22·A33=150 (種).錯誤的原因是沒注意元素為相同的,組合數(shù)已沒有意義了.

正確解答:C24=6 (種)(隔板法).

3 模式識別(對組合模型的識別)

數(shù)學(xué)模式是指形式化地采用數(shù)學(xué)語言,概括地或近似地表述某種事物系統(tǒng)的特征或數(shù)量關(guān)系的一種數(shù)學(xué)結(jié)構(gòu).數(shù)學(xué)中的各種概念、數(shù)學(xué)理論體系、各種定理、公式、法則、算法、命題和方法,都是數(shù)學(xué)模式.而在數(shù)學(xué)問題解決中,具有共同結(jié)構(gòu)的一類問題或具有相同解法的一類問題也稱為一種模式.所謂模式識別,指當(dāng)主題接觸到數(shù)學(xué)問題后,能將該問題歸類、使得與自己認(rèn)知結(jié)構(gòu)中某種數(shù)學(xué)模式相匹配的過程.所以識別類型是數(shù)學(xué)問題的深層次表征.

組合模型是由Dubois提出的,他將簡單的組合結(jié)構(gòu)分成三種模型:即選擇模型、分配模型和分割模型,三種模型定義見下表:

與Dubois的分類相比,國內(nèi)中學(xué)老師對組合問題的分類缺乏理論指導(dǎo),比較零亂,不同老師的分類也不盡相同,有的老師的分類干脆等同于把問題及答案記住.學(xué)生解題時,很難從教師的分類中找到匹配的模式,這就是學(xué)生學(xué)習(xí)排列組合應(yīng)用題難的原因之一.

按三個模型的定義,元素“同”與“不同”,又是兩種本質(zhì)不同的問題;把三種模式組合,又得到綜合類型的問題,例如:選擇——分配模式、分割——分配模式.

按照此種分類方法,學(xué)生對學(xué)習(xí)排列組合應(yīng)用題思路比較清晰,筆者按這種分類方法施教的過程中,學(xué)生學(xué)得比較輕松.中學(xué)里的許多經(jīng)典題目就變?yōu)檫@些模型的實(shí)例:

例4 4本不同的書,按下列條件,各有多少種分法?

(1) 分給甲、乙二人每人2本;(分割——分配模式)

(2) 平均分成二堆,每堆2本;(分割模式)

(3) 分給甲1本,乙3本;(分割——分配模式)

(4) 分成二堆,一堆1本、一堆3本;(分割模式)

(5) 分給甲、乙兩人,一人1本、一人3本;(分割——分配模式)

教學(xué)時先借助樹狀圖或表格,讓學(xué)生弄清楚(1)、(3),再解決(2)、(4)、(5).

(2)解 設(shè)平均分成二堆,每堆2本有x種方法,則(1)的結(jié)果可表示為x·A22=C24·C22,

x=C24·C22A22.

(4)的解法與(2)類似.

例5 (1)7個不同的球,放到4個不同的盒子,共有多少種放法?(可重復(fù)分配模式)

(2)7個相同的球,放到4個相同的盒子,每盒不空,共有多少種放法?(同元同容器分配模式,可用窮舉法求解)

(3)7個相同的球,放到4個不同的盒子,每盒不空,共有多少種放法?(同元不同容器分配模式,可用隔板法求解)

(4)7個不同的球,放到4個相同的盒子,每盒不空,共有多少種放法?(分割模式)

(5)7個不同的球,放到4個不同的盒子,每盒不空,共有多少種放法?(分割——分配模式)

讓學(xué)生在平時解題時,先分析題目中的關(guān)鍵詞語:

(1) 元素是否相同?

(2) 位置(容器)是否相同?

(3) 元素是否可重復(fù)?

(4) 屬于哪種組合模式?選擇、分割、分配,還是選擇——分配模式、或分割——分配模式.?

(5) 其它(如相鄰?不相鄰?入選?不入選?).

例如讓學(xué)生探究下面一題:

例6 某小朋友玩QQ農(nóng)場游戲,他用游戲幣購買了4種不同的蔬菜種子,欲全部種到6塊不同的菜地里,每塊地種一種蔬菜,問他有多少種不同的種法?

探究結(jié)果:將菜地看做不同的元素,種子看做不同的容器.就會發(fā)現(xiàn)此問題屬于分割——分配模式.

第5篇:基因組學(xué)應(yīng)用范文

[摘要]21世紀(jì)是基因科學(xué)高度發(fā)展的世紀(jì),針灸學(xué)可望在“后基因組時代”中發(fā)揮重要的作用。筆者認(rèn)為針灸學(xué)在關(guān)鍵基因調(diào)控方面優(yōu)勢明顯,針灸的作用機(jī)理研究可望通過借鑒基因科學(xué)的先進(jìn)的理論與技術(shù)而有所突破,并借鑒針灸治療潰瘍性結(jié)腸炎的研究思路,提出了21世紀(jì)針灸學(xué)的研究思路與發(fā)展方向。

[主題詞]針灸學(xué);研究設(shè)計(jì);基因組,人GeneScienceandAcupMoxibustionScienceofthe21thCenturyWuHuangan,ZhangBimeng,LiuHuirong(

ShanghaiMunicipalInstituteofAcupmoxibustionandMeridians,Shanghai200030)[Abstract]The21

thcenturywillbeacenturyofhighdegreeofdevelopmentingenescience.Acupmoxibustionsciencemay

playanimportantroleinthe“l(fā)atergenometimes”.Theauthorsholdthatacupmoxibustionsciencehaso

bviousadvantagesinregulationofcriticalfunctionalgenes;studiesonmechanismsofacupunc

tureandmoxibustionmayhavesomebreakthroughbymeansofadvancedtheoriesandtechniqueso

fgenescience.Theyalsoputforwardresearchthinkinganddevelopmentdirectionofacup

moxibustionscienceinthe21thcenturybasedonthinkingofstudyontreatmentofulcer

ativecolitiswithacupunctureandmoxibustion.

[Keywords]AcupunctureMoxibustionScience;ResearchDesign;Genome,Human第一作者簡介:吳煥淦,男,上海中醫(yī)藥大學(xué)教授、博士生導(dǎo)師,上海市針灸經(jīng)絡(luò)研究所副所長。

作為生命科學(xué)的重要組成部分,針灸學(xué)在現(xiàn)代化研究進(jìn)程中,充分吸收、借鑒了生命科學(xué)領(lǐng)域的新思維、新理論、新技術(shù),在針刺鎮(zhèn)痛機(jī)理研究,經(jīng)絡(luò)、腧穴本質(zhì)探討方面取得了一系列進(jìn)展,針灸與神經(jīng)、內(nèi)分泌、免疫系統(tǒng)相關(guān)性研究成果也已為醫(yī)學(xué)界所認(rèn)同。我們也意識到,有關(guān)針灸作用機(jī)理研究和其他與針灸學(xué)發(fā)展密切相關(guān)的問題,不是針灸學(xué)本身所能解決的,只有將其融入生命科學(xué)這一大環(huán)境中,針灸學(xué)才能獲得進(jìn)一步的發(fā)展??梢灶A(yù)測,在到來的21世紀(jì)里,生命科學(xué)必將獲得空前的發(fā)展,“基因科學(xué)”將滲透到醫(yī)學(xué)的各個領(lǐng)域,在新的“基因時代”里,針灸學(xué)將受到哪些影響,它的發(fā)展前景如何?我們應(yīng)該如何把握這一發(fā)展時機(jī)等一系列相關(guān)問題,應(yīng)引起每一位針灸工作者的足夠重視。結(jié)合我們課題組在長期從事針灸免疫(包括分子免疫學(xué))相關(guān)研究過程中所積累的一些經(jīng)驗(yàn),從以下幾個方面提出一些初淺的看法。

1基因組學(xué)快速發(fā)展

自20世紀(jì)以來,生命科學(xué)獲得了極大發(fā)展,特別是1953年DNA雙螺旋結(jié)構(gòu)的發(fā)現(xiàn)以及1985年Crick的遺傳信息傳遞的中心法則的提出,更是極大地促進(jìn)了基因組學(xué)的發(fā)展,從而引發(fā)了一場世界范圍內(nèi)的基因技術(shù)革命,它對整個社會的影響是巨大的,在工業(yè)、農(nóng)業(yè)、環(huán)保、醫(yī)藥等方面顯示出廣闊的發(fā)展前景?;蚪M學(xué)的研究可分為兩個階段:一是以人類基因組DNA的全序列測定為標(biāo)志的“結(jié)構(gòu)基因組學(xué)”階段。自美國從1990年啟動人類基因組計(jì)劃(HGP)以來,已經(jīng)發(fā)展成為一個國際大協(xié)作項(xiàng)目,它的意義可與曼哈頓原子彈計(jì)劃及阿波羅登月計(jì)劃相媲美,但現(xiàn)階段HGP的完成僅為今后全面認(rèn)識人類基因組的功能提供了一個結(jié)構(gòu)基礎(chǔ)[1]。隨之而來的是競爭更為激烈的“后基因組時代”,為了確保我國在未來的生命科學(xué)中占有重要地位,我國確立了從“功能基因組學(xué)”和“疾病基因組學(xué)”入手的研究策略,同時,也認(rèn)識到人類基因組學(xué)的研究方法、研究內(nèi)容與中醫(yī)學(xué)的整體觀、辨證觀有許多相似之處,中醫(yī)藥(包括針灸)在這方面有巨大潛力。

2針灸學(xué)的優(yōu)勢

針灸是在中醫(yī)的臟腑經(jīng)脈等相關(guān)理論的指導(dǎo)下,通過針刺或艾灸來達(dá)到調(diào)整臟腑的陰陽氣血、虛實(shí)正邪等,最終起到治療作用。它擅長從整體上對人體進(jìn)行調(diào)整,并可根據(jù)機(jī)體不同的功能狀況,通過選用不同的穴位或采用不同的針刺手法來達(dá)到調(diào)整機(jī)體功能狀態(tài)之目的。針灸學(xué)作為中醫(yī)學(xué)的重要組成部分,其基本治療思想是將疾病的病理過程作為一個整體,它通過影響多靶點(diǎn)和疾病過程的多個環(huán)節(jié),從而激發(fā)機(jī)體自身內(nèi)在的調(diào)整能力來達(dá)到治療目的[2]。其整合作用不僅表現(xiàn)在影響疾病的病理過程,對體質(zhì)改善也有作用,在解決疾病易感性方面優(yōu)勢明顯。當(dāng)前,人類的疾病由以感染和營養(yǎng)失調(diào)為主的單因素疾病轉(zhuǎn)向以機(jī)體自身代謝和調(diào)控失常為主的多因素疾病,以對抗為主要特征的西醫(yī)未能達(dá)到從根本上改變復(fù)雜的病理過程,難以遏止疾病的發(fā)展[3]。雖然基因科學(xué)帶給醫(yī)學(xué)的影響是巨大的,甚至被稱為“基因科學(xué)導(dǎo)致醫(yī)學(xué)革命”,許多科學(xué)家也提出可以用改變基因結(jié)構(gòu)來治療單基因疾病,但這只是理論上的設(shè)想,迄今為止,基因治療尚不成熟,它的負(fù)面效應(yīng)還不清楚[4]。況且,絕大多數(shù)發(fā)病率高、危害性大的疾病是多基因疾病,是有多個調(diào)控基因失常所致,因此,治療策略應(yīng)該是以修飾或調(diào)控基因表達(dá)與基因產(chǎn)物功能來達(dá)到治療目的。在研究基因組過程中,認(rèn)識到多種致病因素作用于人體,能否發(fā)病以及預(yù)后情況怎樣,是疾病相關(guān)基因與內(nèi)外環(huán)境相互作用的結(jié)果,外因是通過內(nèi)因起作用的,并在此基礎(chǔ)上提出了診治的個體化等新的治療觀念,這與中醫(yī)學(xué)(針灸學(xué))的辨證論治觀相一致。針灸學(xué)在整個發(fā)展過程,都貫穿著辨證論治思想,其以多環(huán)節(jié)、多靶點(diǎn)的整合調(diào)節(jié)為特點(diǎn),在治療與病種方面的優(yōu)勢依然明顯。基因組學(xué)與中醫(yī)針灸學(xué)在思維方法學(xué)上的趨近性,為兩者在研究思路與研究方法的相互滲透提供了可能。

3基因芯片在針灸治療潰瘍性結(jié)腸炎作用機(jī)制研究中的應(yīng)用

有關(guān)針灸作用機(jī)理的研究,古代及近代醫(yī)家都作過探索,但基本上停留在以傳統(tǒng)的中醫(yī)理論進(jìn)行闡述。近半個世紀(jì)以來,國內(nèi)外學(xué)者在針灸作用機(jī)理研究,如針刺鎮(zhèn)痛機(jī)理的研究,針刺對神經(jīng)、免疫、內(nèi)分泌系統(tǒng)調(diào)節(jié)的研究等方面,均作了大量細(xì)致而有意義的工作,并證實(shí)了針刺的確切療效,但尚缺少被人們普遍接受的合理解釋。針灸治療潰瘍性結(jié)腸炎臨床與機(jī)理的系列研究所提供的研究思路,對我們頗有借鑒意義。潰瘍性結(jié)腸炎(UlcerativeColitis,UC)屬難治性疾病,病因涉及免疫系統(tǒng)、環(huán)境,以及尚未確定的慢性腸道炎癥易感基因之間的相互作用。這些相互作用引起一系列級聯(lián)改變,導(dǎo)致慢性腸道炎癥、組織病變和疾病。我們的研究發(fā)現(xiàn):隔藥灸治療UC不僅具有滿意的近期療效,也有一定的遠(yuǎn)期療效,且副作用小[5]。有關(guān)隔藥灸治療UC的臨床及作用機(jī)理的研究成果已得到學(xué)術(shù)界的廣泛認(rèn)同:(1)艾灸治療潰瘍性結(jié)腸炎的形態(tài)學(xué)研究(SCI收錄)[5];(2)從細(xì)胞因子與基因調(diào)控探討針灸治療潰瘍性結(jié)腸炎的機(jī)理(SCI收錄)[6];(3)針灸治療大鼠潰瘍性結(jié)腸炎分子免疫學(xué)機(jī)理研究[7],發(fā)現(xiàn)隔藥灸與電針能夠上調(diào)潰瘍性結(jié)腸炎大鼠結(jié)腸粘膜中IL1ramRNA表達(dá),降低IL1βmRNA、IL6mRNA表達(dá)及iNOSmRNA的表達(dá),從而有效地控制潰瘍性結(jié)腸炎已啟動的炎癥和免疫級聯(lián)反應(yīng)[6、7]。上述研究成果為進(jìn)一步從基因表達(dá)調(diào)控水平上研究UC提供了理論及實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ),也為研究隔藥灸調(diào)節(jié)相關(guān)基因表達(dá)及表達(dá)產(chǎn)物功能提供了重要依據(jù)。但這種只針對單基因的研究思路對揭示UC的發(fā)病本質(zhì)存在一定的局限性,畢竟眾多細(xì)胞因子之間及其與靶細(xì)胞之間是相互影響、相互作用的。

國外有研究選擇性刪除小鼠一個感興趣的基因(或稱為“敲除”)而產(chǎn)生慢性腸道炎癥。特發(fā)性腸道炎癥可以是免疫系統(tǒng)特異基因異常的結(jié)果,在這些有基因改變的動物,正常腸道菌群能誘發(fā)慢性腸道炎癥。但對各種潰瘍性結(jié)腸炎“敲除”突變體模型的思考,強(qiáng)烈支持環(huán)境(在這里指腸道菌群)可能與特異基因(特別是那些上調(diào)或下調(diào)免疫系統(tǒng)者)相互作用而引起潰瘍性結(jié)腸炎的設(shè)想[8]。但無論在生理或病理?xiàng)l件下,在基因表達(dá)調(diào)控、機(jī)體免疫及細(xì)胞分化等重要生命活動中,并非每個基因都是單獨(dú)的發(fā)揮作用,眾多基因是作為一個統(tǒng)一的整體進(jìn)行調(diào)節(jié)的。目前,國內(nèi)尚缺乏全面、深入的相關(guān)研究,未能闡明潰瘍性結(jié)腸炎的確切發(fā)病機(jī)理,這給有效的治療該病帶來了困難。因此,篩選在影響UC的多個環(huán)節(jié)上起作用的分子和起關(guān)鍵性調(diào)控作用的基因,從基因的整體調(diào)控水平來揭示潰瘍性結(jié)腸炎的發(fā)病機(jī)制及針灸治療的可能作用機(jī)制應(yīng)是醫(yī)學(xué)界所關(guān)注的問題。

借鑒生命科學(xué)領(lǐng)域先進(jìn)的理論與方法,應(yīng)用近幾年發(fā)展起來的前沿生物技術(shù)―――基因芯片技術(shù)篩選出UC差異表達(dá)基因及隔藥灸“天樞穴”治療UC的反應(yīng)性基因,并克隆部分未知基因全長cDNA,進(jìn)行功能分析,初步建立“UC相關(guān)基因表達(dá)譜”,闡釋UC的發(fā)生機(jī)制與隔藥灸治療UC的基因調(diào)控和功能修飾的機(jī)制,探討能與隔藥灸起反應(yīng)的基因。這些基因可能是目前已知的與UC相關(guān)的基因,也可能是未知功能的基因,國內(nèi)尚未對潰瘍性結(jié)腸炎基因表達(dá)譜有一個全面的認(rèn)識。因此,從整體水平出發(fā)來研究針灸的基因表達(dá)譜為最終揭示針灸的作用本質(zhì)提供了可能,同時也為針灸的現(xiàn)代化研究提供了一種很好的思路。

自人類基因組計(jì)劃實(shí)施以來,不僅給現(xiàn)代醫(yī)藥學(xué)帶來新機(jī)遇,也為針灸學(xué)的發(fā)展帶來了極好的契機(jī)。國內(nèi)一些學(xué)者已注意到在“功能基因組”與“疾病基因組”的調(diào)控方面,針灸具有巨大的潛力,并且意識到如果在這方面的研究有所突破的話,將使我國在即將來臨的“后基因組時代”處于國際領(lǐng)先地位[2,3]。在考慮將“功能基因組學(xué)”與針灸學(xué)結(jié)合起來進(jìn)行研究時,不僅要嚴(yán)格遵循“功能基因組學(xué)”本身的研究規(guī)律,同時也要認(rèn)識到針灸療法本身的特點(diǎn),選擇針灸療效顯著的潰瘍性結(jié)腸炎進(jìn)行研究,因此,開展“UC隔藥灸”基因表達(dá)譜的相關(guān)研究具有較高的理論與應(yīng)用價值。

實(shí)踐證明,針灸學(xué)只有采取中西醫(yī)結(jié)合方式,運(yùn)用先進(jìn)的現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)與手段,把中醫(yī)基礎(chǔ)理論的闡釋、確切的臨床療效及其作用機(jī)理提供給人們,充分發(fā)揮其在調(diào)控基因功能方面的優(yōu)勢,才能在21世紀(jì)的生命科學(xué)研究中占有一席之地。有理由認(rèn)為,只有充分地將針灸學(xué)的特色融入到生命科學(xué)的領(lǐng)域中,將宏觀現(xiàn)象的研究與微觀機(jī)理的研究緊密結(jié)合起來,針灸學(xué)才能在當(dāng)今迅速發(fā)展的生命科學(xué)里得到豐富和發(fā)展。相信,針灸學(xué)必將在21世紀(jì)里大放光彩。

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7WuHuangan,etal.TheMechanismofiNOSGeneModulationon

第6篇:基因組學(xué)應(yīng)用范文

代表團(tuán)首先參觀考察了以色列農(nóng)業(yè)研究院Newe Yaar研究中心。該中心研究人員詳細(xì)講解了中心各部門的研究內(nèi)容,甜瓜分子遺傳與育種部門負(fù)責(zé)人Kobi研究員就西瓜和甜瓜果實(shí)發(fā)育轉(zhuǎn)錄組學(xué)、西瓜甜瓜糖積累和調(diào)控關(guān)鍵基因定位進(jìn)行深入講解。期間許勇研究員與Kobi研究員重點(diǎn)討論了西瓜和甜瓜轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分享以及對中國-以色列國際合作項(xiàng)目的申請和合作方案進(jìn)行了討論。

圖1 國家西甜瓜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系代表團(tuán)訪問

以色列農(nóng)業(yè)研究院Newe Yaar研究中心

代表團(tuán)考察了以色列新興育種公司Kaiima,公司負(fù)責(zé)人向代表團(tuán)一行講解了該公司獨(dú)創(chuàng)的育種技術(shù)。該公司以非轉(zhuǎn)基因工程為主要思路,以多倍體及雜種優(yōu)勢為主要育種技術(shù),已經(jīng)育成的四倍體雜交玉米、水稻品種,十二倍體小麥、四倍體油菜、三倍體黃瓜等,有些已經(jīng)推向市場,在多倍體誘導(dǎo)過程中,通過控制染色體復(fù)制時紡錘絲對中心粒的牽引這一項(xiàng)專利技術(shù),不損傷染色體與DNA。代表團(tuán)實(shí)地觀察了十二倍體小麥、四倍體油菜等作物植株長勢和產(chǎn)量情況,為體系育種研發(fā)提供了可借鑒思路與技術(shù)路線。

代表團(tuán)在土耳其當(dāng)?shù)赜N專家Derya Güne帶隊(duì)參觀歐洲最大的蔬菜產(chǎn)區(qū)Kumucia,實(shí)地考察了黃瓜、西葫蘆、辣椒、番茄和茄子等生產(chǎn)基地,詳細(xì)了解當(dāng)?shù)氐臍夂驐l件、蔬菜種子來源、蔬菜產(chǎn)量和蔬菜種植農(nóng)戶的人均收入水平等。當(dāng)?shù)刈畲蟮挠缙髽I(yè)DURAN FIDE是當(dāng)?shù)?0個育苗工廠之一,擁有自動點(diǎn)播機(jī)、大型溫室和大型人工氣候室等先進(jìn)設(shè)備。本代表團(tuán)一行獲得了當(dāng)?shù)赜N公司、育苗廠及本地媒體的重視,當(dāng)?shù)孛襟w對代表團(tuán)的來訪予以報(bào)道并刊登于當(dāng)?shù)刂髁髅襟w上。

圖3 西甜瓜產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系成員參加

2012年歐洲植物育種研究學(xué)會

代表團(tuán)在土耳其安塔利亞參加了2012年歐洲植物育種研究學(xué)會葫蘆科植物遺傳育種大會,在葫蘆科作物全基因組測序完成的今天,如何有效利用海量的全基因組數(shù)據(jù),挖掘葫蘆科作物的抗病性、抗逆性、商品品質(zhì)關(guān)鍵基因,并最終應(yīng)用于優(yōu)異種質(zhì)資源的高效篩選是目前國際上葫蘆科作物基因組學(xué)研究的熱點(diǎn)。首席許勇研究員作為大會學(xué)術(shù)委員會委員,在大會上做了“西瓜轉(zhuǎn)錄組、糖積累和代謝研究”的主題報(bào)告,中國多名專家也做了口頭報(bào)告與墻報(bào)。來自美國、法國、土耳其、西班牙、以色列、日本等國家和地區(qū)的葫蘆科作物研究領(lǐng)域的Amnon Levi、Davis Angela、Garcia Mas Jordi、Kotch George 和Todd C. Wehner等200余位權(quán)威學(xué)者就西瓜果實(shí)成熟基因表達(dá)、甜瓜果實(shí)成熟基因表達(dá)譜、甜瓜糖含量基因QTL定位、西瓜漸滲系的構(gòu)建、西瓜糖含量基因QTL定位等研究結(jié)果進(jìn)行了深入交流和探討。會議期間,與波蘭華沙大學(xué)交流了他們在黃瓜隱性gg雌性系基因克隆的進(jìn)展并交換了意見。Ray D. Martyn、M.Babadoost等專家就瓜類枯萎病、美國的瓜類細(xì)菌性果斑病的研究結(jié)果進(jìn)行了交流。體系病蟲害防控研究室主任趙廷昌研究員就相關(guān)問題作了討論交流,國外科學(xué)家特別提示代表團(tuán):瓜類細(xì)菌性果斑病需要你們在國內(nèi)普查和研究。中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院鄭州果樹研究所劉研究員、東北農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝學(xué)院欒非時院長、華中農(nóng)業(yè)大學(xué)園藝林學(xué)學(xué)院別之龍教授及湖南省蔬菜研究所陳惠明研究員等也分別就自己研究領(lǐng)域和國外專家作了深入的交流和討論,對今后研究思路的確立及深入開展工作起到一定借鑒作用。

會議期間代表團(tuán)還參觀考察了土耳其著名育種公司YUKSEL TOHUMCLUK,該公司占有土耳其國內(nèi)25% 的蔬菜種子市場份額,擁有40公頃的蔬菜育種與繁種溫室,同時還參觀了瑞克斯旺(RIJK ZWAAN)種業(yè)公司土耳其分公司。代表團(tuán)了解了各公司的西瓜、甜瓜、黃瓜、西葫蘆和辣椒等品種類型,溫室消毒及肥水一體化技術(shù)的應(yīng)用。最后參觀了BATI AKDENIZ AGRICULTURAL RESEACH INSTITUTE農(nóng)業(yè)研究所,了解了土耳其公益性蔬菜研究所的體制與運(yùn)行機(jī)制以及資源與品種等。

第7篇:基因組學(xué)應(yīng)用范文

基因檢測從醫(yī)學(xué)界走入老百姓生活中,其中很重要的一個原因是“朱莉效應(yīng)”:去年,影星安吉麗娜?朱莉通過基因檢測后發(fā)現(xiàn)其體內(nèi)攜帶一種缺陷基因,罹患乳癌和卵巢癌的風(fēng)險較高。于是,她選擇切除雙側(cè)乳腺,希望將患乳腺癌的風(fēng)險降至最低。

通過基因檢測,就能知道你未來可能患上何種疾病,這樣的場景在理論上并非不能實(shí)現(xiàn)。但在上海百傲科技股份有限公司董事長朱濱看來,疾病易感基因檢測前景雖好,但由于人類基因和疾病的關(guān)系還尚在深入研究階段,易感基因檢測民用化還為時過早。朱濱認(rèn)為,現(xiàn)階段基因診斷較為成熟的應(yīng)用方向是個體化用藥,即根據(jù)患者的基因指導(dǎo)使用不同的藥物和不同的劑量。

過熱的基因檢測

1985年,美國科學(xué)家率先提出被譽(yù)為生命科學(xué)領(lǐng)域的“阿波羅登月計(jì)劃”的人類基因組計(jì)劃。1990年,美國正式啟動人類基因組計(jì)劃。人類基因組計(jì)劃的開啟讓許多年輕人開始了對分子生物學(xué)和基因檢測研究和探索。朱濱,便是深受人類基因組計(jì)劃影響的創(chuàng)業(yè)者之一。

朱濱的大學(xué)時期和研究生時期,專業(yè)方向與藥物分析有關(guān),那時的朱濱已經(jīng)感覺到,藥物分析和分子生物學(xué)有著千絲萬縷的聯(lián)系。人類基因組計(jì)劃啟動四年后,朱濱開始攻讀博士,方向?yàn)榄h(huán)境與基因。也就是從那時候起,朱濱開始接觸到基因檢測。

2000年6月,人類基因組草圖公布,在業(yè)界及股市中都掀起了一股基因熱浪。當(dāng)年,星湖科技宣布斥資2.5億元投資基因芯片,堪稱是上市公司在基因前沿領(lǐng)域的投資大手筆。星湖科技所投資的基因芯片與人類基因組計(jì)劃密切相關(guān),它主要用于基因檢測工作,對大量的遺傳信息進(jìn)行高效、快速的檢測、分析。

在這股基因熱浪中,朱濱創(chuàng)辦了百傲科技,主營方向也是基因芯片。

起初,百傲科技通過研發(fā)產(chǎn)品、產(chǎn)品轉(zhuǎn)讓的形式維持生計(jì)。直至2003年,百傲科技找到了企業(yè)發(fā)展方向,即開展疾病易感基因體檢。百傲科技通過和體檢機(jī)構(gòu)合作,將易感基因檢測結(jié)果展現(xiàn)給醫(yī)生看,由醫(yī)生來綜合判斷后向患者提出保健建議,成為國內(nèi)第一個開展疾病易感基因體檢的企業(yè)。

直至今日,朱濱依舊認(rèn)為疾病易感基因檢測方向前景無量,當(dāng)初其為體檢機(jī)構(gòu)提供的咨詢服務(wù)也具備價值。但朱濱并沒有想到,隨著越來越多的跟隨者加入到疾病易感基因體檢行業(yè),基因檢測的理念和做法開始走樣和變形。

朱濱回憶,一些企業(yè)宣稱基因檢測可以“包測百病”,并將終端客戶由專業(yè)的醫(yī)生變?yōu)椴痪邆鋵I(yè)知識的老百姓。“到后來這個行業(yè)就有點(diǎn)胡說八道了,雖然我們當(dāng)時做得還不錯,但我們一看這行業(yè)都變成這樣了,就趕緊退出不干了?!惫P者了解到,即便在當(dāng)下,基因檢測標(biāo)準(zhǔn)仍不統(tǒng)一,很多機(jī)構(gòu)并不規(guī)范,過度夸大基因檢測的功能使得基因檢測看上去像是“算命”的現(xiàn)象并不少見。

朱濱的擔(dān)憂不無道理。今年年初,國家食藥監(jiān)總局和國家衛(wèi)生計(jì)生委聯(lián)合發(fā)出通知,要求在相關(guān)的準(zhǔn)入標(biāo)準(zhǔn)、管理規(guī)范出臺以前,任何醫(yī)療機(jī)構(gòu)不得開展基因測序臨床應(yīng)用,已經(jīng)開展的,要立即停止。官方給出的原因是,基因測序技術(shù)的臨床使用面臨不少標(biāo)準(zhǔn)缺失,目前絕大部分生物公司、醫(yī)療機(jī)構(gòu)使用的基因測序產(chǎn)品(包括診斷試劑、軟件)都未經(jīng)過醫(yī)療器械的審批注冊。

認(rèn)準(zhǔn)個體化用藥方向

一位業(yè)內(nèi)人士指出,基因檢測技術(shù)本身并無問題,關(guān)鍵是技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)、市場準(zhǔn)入標(biāo)準(zhǔn)缺失。目前我國基因檢測公司技術(shù)手段不同,良莠不齊,一些基因檢測公司強(qiáng)行開展并不成熟的基因檢測項(xiàng)目,造成市場混亂。朱濱在經(jīng)歷過一番魚龍混雜的行業(yè)競爭后,也早已意識到企業(yè)產(chǎn)品納入國家監(jiān)管的重要性。

2005年,美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)首次批準(zhǔn)了一種藥物基因組學(xué)檢測方法,用于藥物代謝酶P450基因多態(tài)性檢測。截止到2011年,美國FDA批準(zhǔn)的70余種藥物的說明書上已有藥物基因組學(xué)信息,用于預(yù)測不同基因型患者在應(yīng)用藥物時的療效和毒性。

在朱濱看來,既然美國明確支持藥物基因組學(xué)檢測方法,那么國內(nèi)遲早也會批準(zhǔn)相關(guān)產(chǎn)品。另一方面,朱濱也意識到,小企業(yè)必須做技術(shù)門檻高的產(chǎn)品。于是在2008年,百傲科技開始認(rèn)準(zhǔn)“個體化用藥的基因診斷”方向進(jìn)行研發(fā)相關(guān)產(chǎn)品,這個方向也被美國FDA、各種專業(yè)協(xié)會、醫(yī)院醫(yī)師普遍接受。

個體化用藥的基因診斷,是指通過基因檢測,能夠知道某一藥物到底該不該用,到底該用多少劑量,從而減少毒副作用、提高療效。數(shù)據(jù)顯示,全球每年約750萬人死于不合理用藥,居死亡人數(shù)第四位。我國每年因藥物不良反應(yīng)住院的患者約250萬名,直接死亡人數(shù)達(dá)20萬人。

Private genes-based medicines inspect through genes and decide whether a medicine is suitable or how much dose is needed to reduce side-effect, enhance efficacy. As data shows, around 7500 thousand people die of misused medicine. About 2500 thousand patients are hospitalized and 200 thousand dead from that in China every year.

基因檢測能夠減少用藥帶來的毒副作用。例如在心血管疾病方面,華法林是常用抗凝藥物,但其不良反應(yīng)卻一直是棘手的問題?;颊呓邮艽笥谒麄兡褪艿膭┝繒r就有危機(jī)生命的出血風(fēng)險,劑量過低則有血栓風(fēng)險,基因檢測則可以幫助確定華法林用藥的適宜劑量。

“個體化用藥分許多方向,百傲科技是國內(nèi)唯一一家以藥物基因組學(xué)為方向的企業(yè),重點(diǎn)做心血管方向的個體化用藥?!敝鞛I解釋說,一個企業(yè)不能什么都想去做,而集中所有資源去攻克市場需求最大的地方,一個一個方面慢慢滲透。

據(jù)介紹,百傲科技是國內(nèi)首個拿到個體化用藥診斷試劑批文的企業(yè)。截止目前為止,百傲科技共有四個獲批的產(chǎn)品,其中三個產(chǎn)品為獨(dú)家產(chǎn)品。

盡管在藥物基因組方向并無多少競爭對手,但百傲科技需要面對的另外一個難題是――為醫(yī)生做培訓(xùn)。據(jù)介紹,目前競爭較為激烈的方向?yàn)槟[瘤基因組方向,即通過基因檢測能夠判斷某一藥物能否使用,使用門檻較低。而藥物基因組方向使用門檻較高,不僅需要知道基因檢測結(jié)果,同時還要結(jié)合既往用藥情況和效果,評估個體對某些藥物的代謝能力、藥物的轉(zhuǎn)運(yùn)率以及藥靶的作用效果,給出個性化用藥指導(dǎo),合理選擇藥物的種類、劑量及劑型。較高的使用門檻要求醫(yī)生具備專業(yè)知識,因此,百傲科技花費(fèi)大量精力在教育市場和培訓(xùn)方面。

第8篇:基因組學(xué)應(yīng)用范文

基因工程的發(fā)展促使它成為生命科學(xué)研究的核心學(xué)科。一般高校都將基因工程這門課作為專業(yè)必修課在大三的第二學(xué)期開設(shè),其先修課程為生物化學(xué)、遺傳學(xué)以及分子生物學(xué)等?;蚬こ痰恼n程內(nèi)容具有兩個特點(diǎn):一是教學(xué)內(nèi)容與其他學(xué)科緊密相連。基因工程不僅與生物化學(xué)等基礎(chǔ)課程的內(nèi)容相互聯(lián)系、交叉重疊,同時又與細(xì)胞工程、蛋白質(zhì)工程、微生物工程等應(yīng)用性課程相互呼應(yīng)與銜接。二是內(nèi)容涵蓋面廣,更新發(fā)展快。隨著人類基因組計(jì)劃的完成,生命科學(xué)的研究已經(jīng)由基因組時代進(jìn)入到后基因組時代,單純的基因測序以及基因工程技術(shù)已經(jīng)不能滿足人類對生命信息的探索與追求。后基因組時代到來的標(biāo)志就是功能基因組學(xué)研究的興起。功能基因組學(xué)研究涉及轉(zhuǎn)錄組、蛋白質(zhì)組以及代謝組等多個方面,多學(xué)科的交叉研究使其發(fā)展迅速。綜上兩個特點(diǎn),為了避免課程知識上的教學(xué)重復(fù),同時又能在有限的教學(xué)課時內(nèi)將基礎(chǔ)知識與最新、最前沿的研究信息最大程度地傳授給學(xué)生,筆者對課程的教學(xué)內(nèi)容及其對應(yīng)的教學(xué)課時進(jìn)行適當(dāng)?shù)恼{(diào)整。以往的基因工程教學(xué)內(nèi)容共有11章32學(xué)時,可歸納為4個部分:第1章,基因工程學(xué)發(fā)展歷史概述、基因工程的基本概念(4課時);第2、3章,基因工程的基本原理及技術(shù),主要圍繞基因工程的基本構(gòu)件載體和工具酶(12課時);第4~10章,基因工程實(shí)施的三大步驟,包括DNA體外重組、重組DNA導(dǎo)入宿主細(xì)胞后擴(kuò)增和表達(dá)以及基因工程后處理(12課時);第11章,基因工程的應(yīng)用與前景(4課時)。筆者在此基礎(chǔ)上對教學(xué)內(nèi)容進(jìn)行了適當(dāng)合理的取舍與增加,做到突出重點(diǎn),加強(qiáng)基本概念和原理的理解,通過列舉實(shí)際應(yīng)用研究來介紹相關(guān)的技術(shù)與方法。同時整合課時分布,在原有的32課時中拿出8課時介紹功能基因組學(xué)研究的知識。其內(nèi)容主要圍繞克隆與表達(dá)后的目的產(chǎn)物(蛋白質(zhì))的提取、分離、純化與鑒定的方法、原理以及技術(shù)。調(diào)整后的課程安排如表1。通過此番改革教學(xué)內(nèi)容,一方面可以開拓學(xué)生的視野,幫助學(xué)生了解基因工程以及功能基因組學(xué)的理論知識和實(shí)際應(yīng)用領(lǐng)域;另一方面也可以激發(fā)學(xué)生學(xué)習(xí)基因工程的積極性與主動性。

2教學(xué)手段與方法的改良

傳統(tǒng)的基因工程教學(xué)方法在水產(chǎn)類高等學(xué)校中多以板書結(jié)合多媒體的方法來講解概念、原理以及性質(zhì)等內(nèi)容,其過程相對機(jī)械、枯燥,使得學(xué)生難以理解所學(xué)內(nèi)容。對此,筆者通過多媒體教學(xué)與自制模型演示相結(jié)合的方法取代原有的傳統(tǒng)教學(xué)。由于基因工程的很多內(nèi)容相對抽象,僅僅通過文字、圖片和語言來表述是難以講解透徹的?,F(xiàn)代的多媒體教學(xué)技術(shù)具有圖文聲像隨意組合、靈活多變的特點(diǎn),為學(xué)生創(chuàng)造了良好的學(xué)習(xí)情境。通過功能強(qiáng)大的各種計(jì)算機(jī)軟件把一些很難理解的內(nèi)容做成動畫影片,化難為易、化靜為動、變抽象為形象,使學(xué)生對上課產(chǎn)生興趣,促進(jìn)學(xué)生對知識學(xué)習(xí)的渴望。同時,利用自制的模型講解課程中的重點(diǎn)以及難點(diǎn)。例如:在介紹限制酶的切割位點(diǎn)時,讓學(xué)生手持模型,分別角色扮演限制酶和基因序列,在排列位置的互換中了解3種切口的方式以及位置。這樣的教學(xué)方法不僅形象,也讓學(xué)生在互動中快速、深刻地記憶知識要點(diǎn)。另外,通過當(dāng)下研究的前沿話題為例,先提出一個問題,引導(dǎo)學(xué)生運(yùn)用其他課程所學(xué)過的或者自身所積累的知識來聯(lián)想、分析、討論,自己設(shè)計(jì)解答此問題的方法或?qū)嶒?yàn)流程。然后老師再參與其中,在討論和修改方法以及實(shí)驗(yàn)流程的過程中,引出所要講授的新的概念和知識要點(diǎn)。

例如介紹表達(dá)物質(zhì)(蛋白質(zhì))的鑒定時,老師會先提出問題:基因克隆表達(dá)出的物質(zhì)是什么?這些物質(zhì)是由什么組成的?鑒定這些物質(zhì)可以使用什么方法?然后引導(dǎo)學(xué)生回顧生物學(xué)中心法則,得出基因表達(dá)物質(zhì)為蛋白質(zhì),蛋白質(zhì)是由氨基酸組成等所學(xué)過的知識,由此學(xué)生可歸納出氨基酸測序法等鑒定蛋白質(zhì)的方法。最后老師再在此基礎(chǔ)上補(bǔ)充出WesternBlot法、生物質(zhì)譜技術(shù)等新的鑒定方法。這樣的講課方式讓學(xué)生回到課堂上的主角位置,在復(fù)習(xí)了以往的知識要點(diǎn)的同時也加深了學(xué)生對新知識的理解與記憶,在一定程度上啟發(fā)了學(xué)生如何去發(fā)現(xiàn)問題和解決問題。此外,基因工程是一門實(shí)踐性很強(qiáng)的課程,在講授理論課的同時,實(shí)驗(yàn)課的安排也是非常重要的。設(shè)計(jì)好與理論課相配套的實(shí)驗(yàn)課程,可以使學(xué)生加深對基因工程學(xué)理論的學(xué)習(xí)和理解,達(dá)到理論和實(shí)踐相結(jié)合的目的。對此,各大高校均在基因工程實(shí)驗(yàn)課上進(jìn)行了改革創(chuàng)新,但有一點(diǎn)總被忽略,那就是實(shí)驗(yàn)研究對象。目前,國內(nèi)大多數(shù)高?;蚬こ虒?shí)驗(yàn)課所使用的研究對象均為果蠅等無脊椎模式生物。這種情況對于普通高校而言是可行的,但是對于擁有特色學(xué)科的水產(chǎn)類高校而言,研究對象也應(yīng)具有其專業(yè)特點(diǎn)。所以本實(shí)驗(yàn)課所使用的研究對象是斑馬魚這種海洋模式生物。研究對象的改變雖微不足道,但是能讓學(xué)生更好地理解自己所學(xué)專業(yè)的特色,在實(shí)踐操作中加深對所屬專業(yè)的熱愛。

3成績考核

中國傳統(tǒng)的應(yīng)試教育產(chǎn)生了“高分決定一切”的迂腐思想。隨著國家教育體系改革的不斷推進(jìn),學(xué)生對于專業(yè)知識的掌握與否,已經(jīng)不能僅從一張考卷成績的高低來反映,考核成績的結(jié)構(gòu)應(yīng)向多元化的方向發(fā)展?;蚬こ痰淖罱K考核成績主要包括兩部分:平時成績占40%,其中課堂出勤率10%、課堂討論10%、課堂小考10%以及實(shí)驗(yàn)報(bào)告10%;期末考試成績占60%。這樣的考核體系改變了過去注重結(jié)果忽略過程的做法,讓學(xué)生在平時將知識一點(diǎn)一滴地積累起來。同時,也讓授課教師能夠及時得到教學(xué)效果的反饋信息,進(jìn)一步提高教學(xué)水平。

4結(jié)語

第9篇:基因組學(xué)應(yīng)用范文

摘 要:分析了代謝組學(xué)技術(shù)對解決中醫(yī)“證”的研究困境和中藥質(zhì)控及安全性評價的意義,指出了運(yùn)用代謝組數(shù)據(jù)模型描述“證”的契合性和重要價值。分析了應(yīng)用代謝組學(xué)構(gòu)建中藥指紋圖譜標(biāo)記研究、有效開展中藥安全性整體評價研究的巨大優(yōu)勢。認(rèn)為代謝組學(xué)將成為中醫(yī)藥研發(fā)的一個重大契機(jī)。必將隨著技術(shù)的進(jìn)步和成熟。將會對中醫(yī)藥現(xiàn)代研究帶來重大突破。

關(guān)鍵詞:代謝組學(xué);中醫(yī);發(fā)展;契機(jī)

中圖分類號:R2~03

文獻(xiàn)標(biāo)識碼:A 文章編號:1673-7717(2008)01-0176-02

中醫(yī)藥學(xué)研究進(jìn)展緩慢,歸咎一點(diǎn),是缺乏自己有力的技術(shù)手段。新近,代謝組學(xué)的興起越來越受到人們的關(guān)注,由于代謝組學(xué)的技術(shù)特點(diǎn)顯現(xiàn)出在中醫(yī)藥學(xué)研究中前所未有的適用性和巨大的應(yīng)用價值,因此必將成為中醫(yī)藥發(fā)展的重大契機(jī)。不少專家看到這一點(diǎn),紛紛發(fā)表文章闡述其應(yīng)用前景。讀罷興奮之余,仍覺意猶未盡,尚有不少問題探討,故不吝管謬,試就代謝組學(xué)對中醫(yī)藥現(xiàn)代研究的適用性及其重要意義作一闡述。

1 代謝組學(xué)簡介